Enterrez ensemble les résidus qui craignent l’eau et regardez l’énergie chuter.
Vous recevez une chaîne de résidus, certains hydrophobes (H) et d'autres non. Pliez-le sur la grille de manière à ce que les résidus hydrophobes se regroupent en un noyau enterré – chaque paire H-H non adjacente qui finit par se toucher diminue l'énergie de la structure. Atteignez l’énergie la plus basse pour le résoudre.
Protein Fold est un puzzle de biochimie construit sur la façon dont les protéines se replient autour d'un noyau hydrophobe, principe qui donne leur forme aux protéines.
Replier une chaîne de résidus hydrophobes et polaires pour que les hydrophobes s'enfouissent dans un cœur, en comptant chaque contact H-H non adjacent, c'est le modèle HP sur réseau du repliement des protéines.
Compter directement les contacts enfouis est la simplification originale.
C'est une simplification radicale qui conserve la physique essentielle. L'effet hydrophobe — les groupes apolaires qui s'agrègent parce que cela maximise l'entropie de l'eau environnante — est la force dominante qui donne sa forme à une protéine, si bien qu'un modèle ne contenant presque rien d'autre produit encore des repliements reconnaissables comme ceux des protéines.
Protein Fold est un puzzle biochimique construit autour de modèles de repliement de protéines à noyau hydrophobe. Il s'agit d'un jeu par navigateur original et gratuit créé en interne pour PlayPendium.