Helixfold
Pliez une chaîne de résidus sur une grille afin que les unités hydrophobes se rassemblent dans un noyau enterré – et réduisez l’énergie à son minimum prouvé.
Comment jouer
Une protéine est modélisée comme une chaîne de résidus hydrophobes (H) et polaires (P) sur un réseau 2D. Les voisins hydrophobes qui sont adjacents sans être liés réduisent l’énergie. Votre objectif est de plier la chaîne pour que les résidus H forment un noyau compact et que vous atteigniez l'énergie optimale.
- Cliquez sur un résidu pour faire pivoter la queue de la chaîne autour de lui.
- Cliquez alternativement sur le même résidu pour pivoter dans la direction opposée.
- Utilisez le bouton Spin pour inverser la direction de pivotement par défaut (dans le sens horaire/antihoraire).
- Atteignez l'énergie minimale prouvable pour que la chaîne remporte le puzzle.
Contrôles
- Bureau : cliquez sur les résidus pour pivoter, cliquez à nouveau pour inverser, activez la rotation et utilisez Réinitialiser pour redresser.
- Téléphone et tablette : appuyez sur les résidus pour pivoter - entièrement tactile.
Conseils et stratégie
- Comptez les contacts H-H, pas la forme - chaque paire hydrophobe non liée qui se retrouve adjacente laisse tomber l'énergie.
- Visez une goutte compacte plutôt qu’un bras long ; la surface exposée aux résidus H est une énergie gaspillée.
- Lorsqu'un pli se bloque, réinitialisez et essayez d'abord d'ensemencer le noyau du groupe le plus dense de résidus H.
Ce que vous apprendrez
Helixfold est construit sur le modèle classique de réseau hydrophobe-polaire de repliement des protéines, transformant la recherche d'un pli en un casse-tête.
- Compétences : biochimie, repliement des protéines, modèle HP, optimisation
- Idéal pour : lycée/collège avancé
- Pour les parents et les enseignants : le modèle HP de repliement des protéines.
À propos d’Helixfold
Helixfold est construit sur le modèle classique de réseau hydrophobe-polaire de repliement des protéines, transformant la recherche d'une conformation à énergie minimale en un puzzle tactile. Il s'agit d'un jeu par navigateur original et gratuit avec trois longueurs de chaîne et des modes d'entraînement quotidiens et quotidiens.
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